眼看王允一点不肯通融，董祀只得去找蔡邕的好友们马日磾、杨彪等人。他们正在一起议论这件事。
他们告诉董祀，董卓死的时候，蔡邕当时正在王允家中做客，听到这个消息后，忍不住惊叹了一声。王允立即勃然大怒，厉声斥责他说：“董卓是祸害国家的奸贼，几乎要毁灭了大汉江山。你是汉家的臣子，应该同我们一样对他怨恨，可是却替他感到悲痛，你这不是要与他一起逆反吗？”说完立即下令将他逮捕。
蔡邕一听赶紧解释说：“我并不是为他叹息，只是哀叹世事难料江山无常。邕虽不才但通晓古今，怎么会袒护董卓呢？”
“你不要狡辩。你怀念他给你的恩惠是不是？他给了你富贵荣华，你留恋这一切。你是他的死党余孽。他死有余辜，你也同样。”
下狱之后，王允立即给蔡邕判了死罪。
蔡邕得知后，立即上书道：“我宁愿忍受刻额染墨、截断双脚的刑罚，也请饶我一命，让我把《汉书》剩下的部分写完。”
王允依然不予理睬。
蔡邕的好友，太尉马日磾听说后，急忙前往对王允说：“伯喈是旷世的奇才，清楚很多汉朝的事，应当让他续写汉代的历史，让它成为一代重要的典籍。蔡邕忠诚孝顺的名声一向显着，获罪也没有特别缘由，杀了他岂不丧失你的威望吗？”
王允却说：“过去汉武帝不杀司马迁，让他写出毁谤的书，流传于后世。现今国家中途衰落，政权不稳固，不能让奸邪谄媚的臣子在幼主旁边写文章。这既不能增益圣上的仁德，又令我们蒙受毁谤议论。你无需多言。”
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