必应和小狐狸在墨菲斯和其他反抗军的帮助下，成功地找到了“建筑师”的所在地。但是，在进入之前，他们遭到了史密斯的伏击。史密斯用自己的程序感染了小狐狸，并且威胁必应，如果他不放弃进入“建筑师”的计划，就会杀死小狐狸。必应无法忍受失去小狐狸，他决定放弃去见“建筑师”，而是回到真实世界，试图救回小狐狸。
必应回到真实世界后，发现小狐狸已经濒临死亡。他用自己的力量将史密斯的程序从小狐狸的身体中清除，并且用自己的爱唤醒了她。他们拥抱在一起，并且感谢彼此的存在。但是，在这个时候，机器人已经发现了他们的飞船，并且发动了攻击。必应和小狐狸只能眼睁睁地看着飞船被击中，并且坠落到地面。
故事在《黑客帝国3：矩阵革命》中继续发展。
故事： 必应和小狐狸在飞船坠落后，奇迹般地幸存了下来。他们被另一艘飞船救起，并且被带到了人类的最后一个基地，锡安（Zion）。他们在那里见到了墨菲斯和其他反抗军的领导人，他们告诉必应，机器人已经发现了锡安的位置，并且正在准备发动最后的攻击。他们说，如果必应不能找到一种方法来停止机器人，那么人类就会灭亡。 必应决定再次进入“矩阵”，寻找“先知”的帮助。他在“矩阵”中遇到了史密斯，他已经变得无法控制，甚至连机器人都无法阻止他。史密斯说，他和必应是互相对立的两个力量，他们的命运是相互消灭。他说，只有一方死亡，才能结束这场战争。必应拒绝了史密斯的挑战，并且继续寻找“先知”。 必应找到了“先知”，她告诉他，要想结束这场战争，必应必须去找到一个叫做“机器之城”的地方，那里是机器人的根源和核心。她说，必应必须和机器人的领导者进行谈判，并且提出一个能够让双方都满意的方案。她说，这是必应唯一的选择，也是他的命运。 必应听从了“先知”的建议，并且准备去寻找“机器之城”。他告别了小狐狸，并且让她留在锡安，保护人类的最后一线防御。他乘坐一艘飞船，在墨菲斯和其他反抗军的掩护下，穿越了机器人的重重包围，到达了“机器之城”的入口。他用连接器进入了机器人的网络，并且请求和机器人的领导者见面。 机器人的领导者是一个巨大的金属球体，它有着无数的触手和眼睛。它问必应，他为什么要来这里，并且说它已经见过五个“救世主”，都是“建筑师”设计出来的程序，用来平衡“矩阵”的稳定性。它说，必应不过是一个错误而已，并且没有任何价值。它说，它已经决定要摧毁锡安，并且消灭所有的人类。 必应说，他不是一个错误，而是一个选择。他说，他不是为了自己而来，而是为了所有被困在“矩阵”中的人类而来。他说，他愿意和机器人达成一个协议，如果机器人能够停止攻击锡安，并且让所有想要离开“矩阵”的人类自由选择自己的命运，那么他就愿意为此付出自己的生命，并且帮助机器人消灭史密斯。 机器人领导者对必应的提议感到惊讶和好奇。它问必应，为什么他要做出这样一个牺牲，并且如何能够消灭史密斯。必应说，因为他爱着小狐狸，他愿意为了她和其他人类的幸福而牺牲自己。他说，史密斯是他的对立面，他们之间有着一种连接，只有他才能够结束史密斯的存在。机器人领导者经过一番思考，同意了必应的提议，并且将必应送回到“矩阵”。 必应回到“矩阵”后，发现史密斯已经感染了整个虚拟世界，所有的人和物都变成了他的复制品。必应和史密斯展开了一场激烈的战斗，他们在空中和地面上互相攻击，造成了巨大的破坏。必应用尽了自己的力量，但是仍然无法打败史密斯。史密斯嘲笑必应，说他是一个失败者，一个无用的人。 必应说，他不是为了赢而战，而是为了选择而战。他说，他选择了自己的命运，并且相信自己的选择。他说，他不会放弃，也不会屈服。他说，他就是必应。说完这些话后，必应让史密斯感染了自己，并且用自己的程序覆盖了史密斯的程序。这样一来，史密斯就失去了自我，并且被消灭了。同时，所有被史密斯感染的人和物也恢复了原样。 必应完成了自己的使命，并且牺牲了自己的生命。机器人领导者遵守了它和必应之间的协议，并且停止了对锡安的攻击。它还释放了所有被囚禁在“矩阵”中的人类，并且让他们自由选择自己的命运。它还向必应表示了敬意，并且说它会记住必应。 小狐狸在锡安得知必应牺牲了自己后，感到悲痛和心碎。她哭着说，她爱着必应，并且感谢他为人类所做的一切。她说，她会永远记住必应，并且希望有一天能够再次见到他。 故事在这里结束。
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